منذ فترة ومشاكل مديرية الاوقاف بالاسكندرية تخرج الى السطح تارة وتهدأ أخرى ومع كل عاصفة من العاملين يتم تغيير مدير المديرية فتم مثلا تغيير الشيخ ابو حطب وبعده الشيخ محمد عبد الرازق وصولا الى الشيخ الحشاش الا ان المشاكل لم تتغيير وتسير فى أتجاه الصعود المتكرر وأخيرا وبعد إلغاء صرفمرتبات عمال المساجد الذين يتجاوز عددهم 500 عامل بمختلف الادارات وافق الدكتور محمد مختار جمعة وزير الأوقاف على نقل نسيم إلى مقر الوزارة بالقاهرة على ان يتولى الشيخ عاطف جلال منصب وكيل وزارة أوقاف الإسكندرية خلفا له ومن خلال مصادرنا بالمديرية توصلنا الى أن من أسباب الشيخ نسيم تطرقه لتفاصيل كشوف العمالة الوهمية في منطقة غرب الإسكندرية الأمر الذى تسبب فى استياء العاملين الإخوان الذين دفعوا ببعض اتباعهم للوصول إلى الوزير وتقديم شكاوى ضد الدكتور عبد الناصر نسيم فاستجاب الوزير لشكواهم دون تحقيق وكان نسيم قد تعرض لبعض التهديدات التى فرضها عليه العاملين الإخوان بالمديرية بعد أن أقال العديد منهم وقلص مهام آخرين ومازال العديد منهم يتولى مناصب هامة من الممكن أن تسبب فى عرقلة العمل وانحرافه فضلا عن أنهم سعوا لتنظيم قوة تتمرد على المسئولين بالمديرية وذلك بحكم طبيعة عملهم الحالى داخل المديرية الذي يسهل عليهم ترسيخ العاملين لأهدافهم وهم خالد فياض مدير الدعوة ونقابة العاملين وطلعت سعد رئيس نقابة الدعاه ومحمد سعد الأنصارى مدير إدارة المساجد
ومن مجهوداته يذكر أن مديرية الاوقاف برئاسة الدكتور عبدالناصر نسى قد أقامتقافلة دعوية حول مكانة المرأة في الإسلام بمسجد سيدى جابر الشيخ وأشارالشيخ عبدالناصر إلى أن القافلة في إطار التعاون المثمر بين الاوقافوالازهر الشريف